保持培養箱內恒定的溫度是維持細胞健康生長的重要因素，因此精確可靠的溫控系統是培養箱不可或缺的重要部分。為了使培養箱更加穩定的工作，我們推薦用戶選用具備相互獨立三重溫度控制功能的二氧化碳培養箱，即箱內溫度控制、超溫報警控制和環境溫度監控。
獨立箱內溫度控制系統：保證培養箱內溫度能夠精確的穩定在用戶的設定值上，并且主加熱系統具有正常/緩慢兩種加熱模式，更加耐受室溫較高的環境使用，我們知道培養箱的最低工作溫度一般是高于室溫5°C，如果沒有緩慢加熱模式就非常容易在夏天高溫天氣（如室溫30°C左右時）產生箱內溫度過高，影響溫度波動度精度；
獨立超溫報警功能：能夠快速準確的在培養箱內溫度高于培養溫度1°C時，切斷培養箱的主加熱系統，同時聲光報警；
環境溫度監控：可以根據環境溫度的變化自動調節培養箱外門輔助加熱系統的功率，達到精確控制箱體內溫度的目的。
加熱方式：氣套式加熱和水套式加熱
兩種加熱系統都是精確和可靠的，同時它們都有著各自的優點和缺點。
水套式加熱是通過一個獨立的水套層包圍內部的箱體來維持溫度恒定的，其優點：水是一種很好的絕熱物質，當遇到斷電的時候，水套式系統就可以比較長時間的保持培養箱內的溫度準確性和穩定性（維持溫度恒定的時間是氣套式系統的3－4倍），有利于實驗環境不太穩定（如有用電限制，或者經常停電）并需要保持長時間穩定的培養條件的用戶選用。
氣套式加熱是通過遍布箱體氣套層內的加熱器直接對內箱體進行加熱的，又叫六面直接加熱。氣套式與水套式相比，具有加熱快，溫度的恢復比水套式培養箱迅速的特點，特別有利于短期培養以及需要箱門頻繁開關的培養。此外，對于使用者來說氣套式設計比水套式更簡單化（水套式需要對水箱進行加水、清空和清洗，并要經常監控水箱運作的情況）。
